El Instituto Francisco Xavier Alegre A. C., inicia sus actividades en la ciudad de Xalapa, Ver. en junio de 1978 con el nivel secundaria y tres años más tarde apertura el bachillerato. La escuela se encontraba ubicada en la calle de Altamirano número 78 esquina con Betancourt, donde actualmente existe Cáritas, que es un espacio donado para obras sociales y educativas por un benefactor cuya única condición era que la institución que allí se estableciera debiera llevar el nombre de su difunta esposa, motivo por el cual el Instituto llevó el nombre de Leonor Vignola, mientras se albergó en aquella antigua y nostálgica casona. En el año de 1977 un grupo de jóvenes profesionistas, la mayoría de ellos pertenecientes a las secciones juveniles de la Acción Católica Mexicana, tuvieron la iniciativa de fundar una escuela que brindara formación humana y cristiana sólidas junto con una educación de calidad. Posteriormente se incorporan otras personas que apoyan y suman esfuerzos, como benefactores, colaboradores y padres de familia interesados en inscribir a sus hijos en esta escuela. Es así como se constituye la Asociación Civil “Instituto Francisco Xavier Alegre A.C.,” que consolidará legalmente al IFXA. Quedando constituida como una asamblea de asociados de entre los cuales se elige una junta directiva, asamblea que con el tiempo se le ha denominado “Patronato”.
Los firmantes del Acta Constitutiva de la Asociación Civil fueron, en orden alfabético nominal: Profesor Ambrosio Soto Alemán, Sr. Basilio Rafael Hernández Guerola, Srita. Carolina Pérez Vignola, Sr. Cristóbal Marqués López, Lic. Emilio Palacios Ríos, Sra. Gloria Rosas de Balderas, Lic. José Ángel Torres Robles, Lic. Librado Basilio Juárez, Srita. Ma. Del Carmen Torres Robles. Sr. Miguel Ángel Torres Robles, Sr. Miguel Rosas López, Lic. Pedro Pérez Vignola, LAE. Víctor Manuel Palacios Sosa. A los que se unieron posteriormente el Sr. Enrique Eguía Sariego, el Ing. Gustavo Manuel Balderas Rosas, y varias otras personas incluyendo hasta nuestros días a exalumnos y directivos. Además de los firmantes del acta, otras muchas personas colaboraron para hacer posible esta obra, algunos construyendo mobiliario, prestando sus servicios en forma gratuita, promoviendo a la escuela. Entre los fundadores se encuentran los primeros maestros y personal administrativo, que fueron la verdadera alma y los protagonistas del Instituto, por su amor y compromiso. Estos pilares fundadores del IFXA, en orden alfabético nominal, son: Alejandro Cossío Licona, Antonio López, Sacerdote Comboniano, Basilio Hernández Guerola, Bernardo Agustín Palacios Sosa, Carolina Pérez Vignola, Clara Soto Díaz, Cristóbal Márquez López, Gloria Rosas de Balderas, José Ángel Torres Robles, Josefina Rivas Espinoza, Juan Alfonso Montenegro Ramírez, Laura Martínez Márquez, Manuel Núñez Pérez Redondo, María Eugenia Cano Oliver, Martha Zamudio Aguilar, Miguel, Rosas López, Miguel Ángel Torres Robles, Olivia Rodríguez Suárez, Patricia Mercado de Núñez, Pedro Pérez Vignola, Roberto Manuel Nava Kuri, Tomas Conn S. J., Víctor Manuel Palacios Sosa.
Alumnos fundadores en orden alfabético nominal. 1er año de secundaria: Arturo Márquez Murrieta, Agustín Basilio de la Vega, Alberto Chimal Castro, Alicia Eguía Casis, Emilio Rafael Gutiérrez Sánchez, Gerardo Rechy Paniagua, Germán Bosco Martínez Márquez, Gloria del Carmen Balderas Rosas, Gustavo Ríos Hernández, Jorge Ignacio Zea Grayeb, José Luis Cuevas Gayosso, María Lucila de los Ángeles Arcos Merino, María Luisa Maritza Loyo Sánchez, Mario Alberto Huerta Hernández, Mario Galindo Cárdenas, Martha Emilia Lagunes Jácome, Miguel Ángel Sánchez Bravo, Miriam Huerta Hernández y Monsterrat E. Luna Hernández. 2º año de secundaria: Jaime Antonio Zea Grayeb, Jorge Silva Alegría, José Gabriel Palacios Quiroz, José Obed Rodríguez Quiroz, Marco Vinicio Jacobo Ruiz Ibáñez, Sergio Contreras Rodríguez. 3er año de secundaria: Juan Eusebio Palacios Quiroz, Martha Josefina Torres Robles y Pedro Rafael Torres Benítez.
Nuestro reconocimiento a los benefactores que sin pertenecer al cuerpo pertenecieron al alma IFXA: Excelentísimo señor Dr. don Emilio Abascal y Salmerón, Pbro. Benjamín Ayala López, Pbro. Celestino Barradas, Arq. Fernando Pérez Vignola, Sr. Rafael Meza Meza, C. P. Sergio Colorado y a tantos otros que de manera anónima hicieron su aportación. En 1981 el IFXA abre sus puertas el nivel de bachillerato. Para el año de 1986 se traslada a sus propias instalaciones, en la avenida 20 de noviembre oriente número 70, donde actualmente recibe a las generaciones de niños y jóvenes de secundaria y bachillerato. Cambiando así el nombre de las escuelas de Leonor Vignola, por el que originalmente se pensó en honor al ilustre pensador veracruzano Francisco Xavier Alegre y que se conservó en la asociación civil.
Lista de directores del Instituto Francisco Xavier Alegre, A.C., niveles secundaria, bachillerato o ambos, en orden cronológico desde su fundación hasta nuestros días: Maestro Víctor Manuel Palacios Sosa (1978-1981).
Lic. Pedro Andrés Pérez Vignola (1981-1981).
Maestra Gloria Rosas de Balderas (1981-1981 y 1982-1987).
Profra. Carmen Sandoval Pérez (1981-1982).
Maestro Carlos Moreno Castillo (1988-1989).
Maestra Irma Lilia Luna Fuentes (1988-1989).
Maestro José Gabriel Palacios Quiroz (1989-1990).
Maestra Olivia Rodríguez Suárez (1990-1992).
Maestra Sandra Elvira Hazas Arróniz (1992-a la fecha)
Algunos estudiantes que han colaborado como profesores o personal administrativo del IFXA, en orden alfabético nominal son: Ing. Agustín Basilio de la Vega, Dra. Alicia Eguía Casis, Ing. Alfonso Robles Aguilar, Maestro. Carlos Núñez Mercado, Profra. Cristina Basilio Hazas, Maestra Cristina Pérez Silva, Lic. Daniel Francisco Murga Segovia, Lic. Fabiola Velázquez Lara, Mtra. Gloria del Carmen Balderas Rosas, Lic. Guadalupe Carolina Palacios Pérez, Lic. Ingrid Cruz Cebada, Mtro. José Gabriel Palacios Quiroz, Lic. Juan E. Palacios Quiroz, IQ. María Luisa Maritza Loyo Sánchez, Lic. Pedro Hugo Pérez Ortega, Lic. Rebeca Martínez Rodríguez, Lic. Víctor Manuel Marín González, Dr. Víctor Manuel Sosa Suárez."
Los académicos que han colaborado en diferentes etapas del IFXA por más de diez años, en orden alfabético nominal son: Maestro Ambrosio Soto Alemán Maestra Amparo González Montes, Maestra Ana Graciela López Herrera, Maestro David Reyes Utrera, Maestra E. del Carmen Aguirre Martínez, Maestra Faustina Aguilar Hernández, Maestro Gonzalo Herrera Barreda, Maestra Ivette Amante Carmona, Maestro José Gabriel Palacios Quiroz. Maestro Karym Vázquez Cervantes, Maestra María Isabel Soto Montano, Maestra Olivia Rodríguez Suárez, Maestra Reyna del Carmen Hernández Aguirre, Maestra Sandra Elvira Hazas Arróniz, Maestra Teresa Adriana Chávez Rivas.
Srita. Luz María Murrieta Baizabal, Lic. Rosalía Linares Reyes.